2024 Автор: Elizabeth Oswald | [email protected]. Акыркы өзгөртүү: 2024-01-13 00:09
Гомология моделдерин структуралык жактан баары чечиле элек байланыштуу протеиндердин ортосундагы тымызын айырмачылыктарды аныктоо үчүн да колдонсо болот . Мисалы, ыкма Na+/K+ АТФазадагы катиондорду байланыштырган жерлерди аныктоо жана ар кандай АТФазалардын байланышуу жакындыгы жөнүндө гипотезаларды сунуштоо үчүн колдонулган..
Гомология моделдери эмне үчүн колдонулат?
Гомологияны моделдөө - бул белоктун 3D түзүлүшүн аминокислота ырааттуулугунан аныктоо үчүн колдонулганэсептөө түзүмүн болжолдоо ыкмаларынын бири. Эсептөө структурасын болжолдоо ыкмаларынын ичинен эң такы болуп эсептелет. Ал жөнөкөй жана колдонууга оңой болгон бир нече кадамдардан турат.
Гомология моделдөө деген эмне жана ал эмне үчүн керек?
Гомологиялык моделдөө шаблон менен максаттуу ырааттуулуктун ортосундагы окшоштукка негизделген максаттуу белоктун үч өлчөмдүү түзүлүшүн алат жана бул ыкма мембраналык белокторду изилдөөгө келгенде эффективдүү экенин далилдейт. GPCR сыяктуу кристаллдашуу кыйын, анткени ал …
Гомология моделин кантип жасайсыз?
гомологияны моделдөө үчүн бир нече кадамдар бар
- максатыңыздын ырааттуулугу менен үлгү тандоо. Бул максатта бардык жеткиликтүү белок структураларына (PDBs) каршы BLASTp издөөнү жасай аласыз. …
- Шаблонду жана максаттуу ырааттуулукту тегиздөө. …
- Моделиңиздин сапаты. …
- Тактоомоделиңизге жараша.
Гомологияны моделдештирүү эмнеде?
Эгер эмпирикалык структурадан <=2 Å rmsd болгон "өтө ийгиликтүү гомология моделин" аныктасак, анда шаблон ийгиликке жетишүү үчүн максаттуу >=60% ырааттуулукка ээ болушу керек баа >70%. Атүгүл жогорку ырааттуулуктагы идентификацияларда (60%-95%), ар бир он гомология моделинин rmsd >5 Å vs. бар
Сунушталууда:
Nunc pro tunc качан колдонуу керек?
Nunc pro tunc - бул буйрук же өкүмдө сот буйруктун же өкүмдүн датага эмес, өткөн датага карата күчүнө киришин каалаган учурда колдонулган сөз айкашы өкүм же буйрук соттун протоколуна киргизилет. Nunc pro tunc келишими деген эмне? Чечим nunc pro tunc алдынкы чечимде соттук эмес, канцелярдык катаны оңдоо боюнча биринчи инстанциядагы соттун аракети.
Коллокацияларды качан колдонуу керек?
Коллокация – бул биз чогуу колдонулган эки сөз. Мисалы, биз "бийик имарат" эмес, "бийик имарат" дейбиз. ар дайым англис тилинде коллокацияларды колдонобуз, андыктан аларды үйрөнүү жана колдонуу сизди табигыйраак кылат. Эмне үчүн коллокацияларды колдонобуз?
Качан i.e. жана качан колдонуу керек, мисалы?
б.а. id est деген сөз айкашынын аббревиатурасы болуп саналат, ал "башкача айтканда" дегенди билдирет. б.а. анын маанисин тактоо үчүн мурда айтылган нерсени кайра айтуу үчүн колдонулат. мис. "мисалы" дегенди билдирген "
Полиакриламидди качан жана качан агарозду колдонуу керек?
Агароза гелдери ДНК менен колдонулат, себеби биомолекулалардын көлөмү чоңураак (ДНК фрагменттери көбүнчө миңдеген кДа). Белок гелдери үчүн полиакриламид жакшы резолюцияны берет, анткени алда канча кичирээк өлчөмдөгү (50 кДа типтүү) гелдин молекулалар аралык боштугуна көбүрөөк ылайыктуу.
Качан колдонуу керек жана керек?
Керек жана Керек - Кандай айырма бар? Керектүү - муктаждыктын туунду термини. Керектүү жана муктаждыктын ортосундагы этиштер катары. муктаждык (эскирген|өтмө) керек болсо (бирөөгө). Сын атооч катары керек. керектүү; керек болуп жатат.
