Молекулярдык биологияда, STRING (Өз ара аракеттенүүчү гендерди/белокторду издөө үчүн издөө куралы) - белгилүү жана болжолдонгон протеин-белок өз ара аракеттенүүсүнүн биологиялык маалымат базасы жана веб-ресурсу. … 11b акыркы версиясында 5000ден ашык организмдин 24,5 миллион протеин жөнүндө маалымат камтылган.
STRING маалымат базасынын максаты эмне?
STRING маалымат базасы белгилүү жана болжолдонгон протеиндердин– көп сандагы организмдер үчүн протеиндердин ассоциациясынын маалыматтарын консолидациялоо менен бул маалыматты чогултууну жана интеграциялоону максат кылат.
STRING упай деген эмне?
STRINGде ар бир белок-белок өз ара аракеттенүүсү бир же бир нече "упайлар" менен түшүндүрүлөт. Маанилүүсү, бул упайлар өз ара аракеттенүүнүн күчүн же өзгөчөлүгүн көрсөтпөйт. Тескерисинче, алар ишенимдин көрсөткүчтөрү, б.а. STRING өз ара аракеттенүүнү канчалык деңгээлде чын деп баалайт, жеткиликтүү далилдерди эске алуу менен.
Эмне үчүн белоктор өз ара аракеттенишет?
Белок-белок өз ара аракеттешүүсү (PPIs) - электростатикалык күчтөрдү, суутекти камтыган өз ара аракеттенүү аркылуу башкарылган биохимиялык окуялардын натыйжасында эки же андан көп протеин молекулаларынын ортосундагы жогорку өзгөчөлүктөгү физикалык контактылар байланыш жана гидрофобдук эффект.
Функционалдык ассоциация деген эмне?
аныктоо. Биологиялык объектилердин ортосундагы экилик байланыш алардын бири экинчисин функция, экспрессия, деградация же экинчисинин туруктуулугу жана өз ара мамилелер боюнча модуляциялагандаөнөктөштөрдүн ортосундагы түздөн-түз аныктоо мүмкүн эмес, андыктан ортодогу кадамдар кыйыр түрдө көрсөтүлөт.
