Хромосома конформациясын тартууга (3C) негизделген ыкмалар хроматинбоюндагы жуп чекиттердин физикалык жакындыгын аныктоо аркылуу ядронун ичиндеги хромосомалардын түзүлүшүн ачып берет. Алар хроматиндин өз ара аракеттенүүсүн кайчылаш байланышты, андан соң өз ара аракеттенүүчү аймактарды фрагментациялоо, байлатуу жана секвенирлөө аркылуу сакташат.
Хромосома конформациясы кантип иштейт?
Хромосома конформациясын чипте кармоо (4C) бир локус менен башка бардык геномдук локустун ортосундагы өз ара аракеттенүүнү тартат. Бул тескери ПТР жүргүзүү үчүн колдонулган өзүн-өзү айланма ДНК фрагменттерин түзүү үчүн экинчи ligation кадамын камтыйт. … Бир микро массивде болжол менен миллион өз ара аракеттенүүнү талдаса болот.
Хроматин конформациясын тартуу деген эмне?
Хроматин конформациясын тартуу (3C) - хроматин түзүлүшүн изилдөө үчүн колдонулган маанилүү ыкма, ошондой эле бир нече башка туунду ыкмалардын негизи. … Протокол формальдегиддин клеткалардын кайчылаш байланышын, андан кийин хроматинди изоляциялоону жана чектөө ферменти менен сиңирүүнү камтыйт.
Hi-C тартиби кантип иштейт?
Hi-C ыкмасы 3C-Seq кеңейип, хроматин контакттарын геном боюнча картага түшүрөт жана ал in situ хроматиндин өз ара аракеттенүүсүн изилдөө үчүн да колдонулган. Бул ыкмада ДНК-белок комплекстери формальдегид менен кайчылаш байланышта болот. Үлгү бөлүкчөлөргө бөлүнүп, ДНК экстракцияланат, байланат жана чектөө ферменттери менен сиңирет.
Hi-C техникасы деген эмне?
Классикалык Hi-C техникасы формальдегиддин кайчылаш байланышкан геномунун ырааттуулугу чектелген чектөө ферменттерименен сиңирүүнү чектөөнү, андан кийин сиңирилген учтарды толтуруу жана оңдоону камтыйт. биотин менен байланышкан нуклеотиддер. Оңдолгон учтары кайра байланат.
